Számos elbeszélés és mítosz kering a város létrejöttéről. Ciprust Afrodité, a szépség és szerelem istennőjének szigeteként ismerik. Páfosz mellett található Afrodité sziklája, ahol a legenda szerint az istennő kilépett a tenger habjaiból, így nem csoda hogy a város is hozzá köthető.
Egy mítosz szerint Pygmalion, a híres ciprusi szobrász olyan gyönyörű elefántcsont szobrot faragott, amibe beleszeretett. Imái meghallgattattak, és az istennő kívánságát teljesítve életre keltette Pygmalion művét, aki a Galatea nevet kapta. Közös gyermeküket Páfosznak nevezték el, aki Afrodité dicsőítésének szentelte életét. Az istennőnek több szentélyt, templomot emeltek, az elsőt állítólag a mükénéi korszakban, a Kr. e. 12. században.
Bár a város alapítására nincsenek biztos adatok, egy monda szerint Knirasz király alapította (a jelenlegi Kouklia környékén), Új-Páfoszt pedig Nikoklész királyhoz kötik, mások Agapinornak tulajdonítják az alapítást. Az ókorban jelentős szerepe volt, hiszen a sziget kormányzásának központja volt Páfosz.
Sok jelentős személy és mitológiai, történelmi alak élt és munkálkodott a szigeten: magától Afroditétól és Adonisztól kezdve a ciprusi származású Barnabás apostolon át Szent Pálig, aki térítő munkát végzett itt. Történeteik, ereklyéik és emlékeik mai napig jelen vannak Cipruson.
A sziget különleges adottságai végett megszállók sokaságát vonzotta az évezredek során. Szaracénok, Egyiptom, a Római és Bizánci Birodalom, a Török Birodalom, Anglia és sok más nép is mind nyomot hagytak Ciprus történelmében és kultúrájában.
Páfosz sokáig egy egyszerű halászfalu volt, a 20. század vége felé, a polgárháború időszakát követően azonban jelentős fejlődésnek indult, és mára az egyik legnépszerűbb turistaparadicsommá nőtte ki magát.
A város történelmi értékei az UNESCO által a Világörökség részévé lettek nyilvánítva, egyes területek a régióban természetvédelmi értékeket képviselnek, valamint
2017-ben Páfosz volt Európa Kulturális fővárosa is.
Páfosz történelmi jellegét megőrizve is folyamatos fejlődés alatt áll, számos felújítás és modernizálás történt az elmúlt években, és tart jelenleg is.